Във втората част главният антагонист ще бъде Алекс Мерсер - героят на първия Prototype. Новият главен герой ще бъде неизвестният досега сержант Джеймс Хелър, а действието на играта ще се развива предимно в Ню Йорк.

Вече беше показан трейлър на продължението, над което работи същото студио, което създаде и първата част - Radical Entertainment. Издатели на Prototype 2 ще бъдат Activision, а играта ще излезе за Xbox 360, PS3 и PC.

Prorotype 1 беше научно-фантастичен екшън от 2009, посветен на проблемите на оцеляването в свят, където хората са мутирали заради вирус, като действието в него също се развиваше в Ню Йорк. Втората част на Prototype беше обявена в края на 2010 на церемонията Spike Video Game Awards, припомня БГНЕС.